Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIGQ13278 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIGQ13278 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIGQ13278 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIGQ13278 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIGQ13278 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIGQ13278 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIGQ13278 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIGQ13278 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIGQ13278 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIGQ13278 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIGQ13278 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RIGQ13278 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIGQ13278 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIGQ13278 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIGQ13278 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIGQ13278 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIGQ13278 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIGQ13278 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIGQ13278 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIGQ13278 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIGQ13278 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIGQ13278 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIGQ13278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIGQ13278 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIGQ13278 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIGQ13278 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIGQ13278 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIGQ13278 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIGQ13278 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIGQ13278 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIGQ13278 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIGQ13278 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIGQ13278 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIGQ13278 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIGQ13278 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIGQ13278 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIGQ13278 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIGQ13278 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIGQ13278 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIGQ13278 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIGQ13278 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIGQ13278 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIGQ13278 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIGQ13278 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIGQ13278 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIGQ13278 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIGQ13278 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIGQ13278 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIGQ13278 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIGQ13278 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIGQ13278 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIGQ13278 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIGQ13278 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIGQ13278 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIGQ13278 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIGQ13278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RIGQ13278 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RIGQ13278 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIGQ13278 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIGQ13278 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIGQ13278 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RIGQ13278 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIGQ13278 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RIGQ13278 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RIGQ13278 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RIGQ13278 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RIGQ13278 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RIGQ13278 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RIGQ13278 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIGQ13278 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIGQ13278 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIGQ13278 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RIGQ13278 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIGQ13278 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIGQ13278 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIGQ13278 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIGQ13278 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RIGQ13278 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIGQ13278 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIGQ13278 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIGQ13278 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIGQ13278 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIGQ13278 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIGQ13278 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIGQ13278 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIGQ13278 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIGQ13278 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RIGQ13278 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIGQ13278 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIGQ13278 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIGQ13278 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIGQ13278 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIGQ13278 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIGQ13278 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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