Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 AGP1YCL025C 1902 nt15.7■□□□□ 0.1
TY1B-BRQ12193 CLB6YGR109C 1143 nt15.69■□□□□ 0.1
TY1B-BRQ12193 AAC1YMR056C 930 nt15.66■□□□□ 0.1
TY1B-BRQ12193 YCR102CYCR102C 1107 nt15.65■□□□□ 0.1
TY1B-BRQ12193 GOR1YNL274C 1053 nt15.64■□□□□ 0.09
TY1B-BRQ12193 LOT5YKL183W 921 nt15.63■□□□□ 0.09
TY1B-BRQ12193 BOP3YNL042W 1191 nt15.63■□□□□ 0.09
TY1B-BRQ12193 RIB3YDR487C 627 nt15.59■□□□□ 0.09
TY1B-BRQ12193 RTF1YGL244W 1677 nt15.57■□□□□ 0.08
TY1B-BRQ12193 HIP1YGR191W 1812 nt15.57■□□□□ 0.08
TY1B-BRQ12193 YEL008WYEL008W 381 nt15.56■□□□□ 0.08
TY1B-BRQ12193 TIR3YIL011W 810 nt15.55■□□□□ 0.08
TY1B-BRQ12193 BDF1YLR399C 2061 nt15.54■□□□□ 0.08
TY1B-BRQ12193 TAT1YBR069C 1860 nt15.51■□□□□ 0.07
TY1B-BRQ12193 GUT2YIL155C 1950 nt15.5■□□□□ 0.07
TY1B-BRQ12193 YPI1YFR003C 468 nt15.5■□□□□ 0.07
TY1B-BRQ12193 RAX1YOR301W 1308 nt15.46■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 PIB2YGL023C 1908 nt15.45■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.45■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 TIF6YPR016C 738 nt15.45■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 ZTA1YBR046C 1005 nt15.44■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 CCA1YER168C 1641 nt15.44■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 NAP1YKR048C 1254 nt15.44■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 NBP35YGL091C 987 nt15.43■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 AQY2YLL052C 450 nt15.42■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 APT2YDR441C 546 nt15.41■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 YJR114WYJR114W 393 nt15.4■□□□□ 0.06
TY1B-BRQ12193 ATG15YCR068W 1563 nt15.39■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 PGC1YPL206C 966 nt15.39■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 POM34YLR018C 900 nt15.38■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 PAU5YFL020C 369 nt15.36■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 RIB2YOL066C 1776 nt15.36■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 GND1YHR183W 1470 nt15.35■□□□□ 0.05
TY1B-BRQ12193 YFL054CYFL054C 1941 nt15.31■□□□□ 0.04
TY1B-BRQ12193 PRO1YDR300C 1287 nt15.3■□□□□ 0.04
TY1B-BRQ12193 SLG1YOR008C 1137 nt15.29■□□□□ 0.04
TY1B-BRQ12193 MET28YIR017C 564 nt15.28■□□□□ 0.04
TY1B-BRQ12193 YJL064WYJL064W 396 nt15.27■□□□□ 0.04
TY1B-BRQ12193 PTK1YKL198C 1989 nt15.26■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.25■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.25■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 AKR2YOR034C 2250 nt15.25■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.25■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 YBR232CYBR232C 360 nt15.22■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 ALD4YOR374W 1560 nt15.21■□□□□ 0.03
TY1B-BRQ12193 PAU19YMR325W 375 nt15.21■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 YML089CYML089C 369 nt15.19■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 SMM1YNR015W 1155 nt15.19■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 YJL055WYJL055W 738 nt15.17■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 TIP1YBR067C 633 nt15.17■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 DUS1YML080W 1272 nt15.15■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 FIT3YOR383C 615 nt15.15■□□□□ 0.02
TY1B-BRQ12193 UGA4YDL210W 1716 nt15.1■□□□□ 0.01
TY1B-BRQ12193 PRY1YJL079C 900 nt15.09■□□□□ 0.01
TY1B-BRQ12193 LSC2YGR244C 1284 nt15.08■□□□□ 0.01
TY1B-BRQ12193 SWE1YJL187C 2460 nt15.06■□□□□ 0
TY1B-BRQ12193 ERG6YML008C 1152 nt15.04■□□□□ -0
TY1B-BRQ12193 STR3YGL184C 1398 nt15.02□□□□□ -0.01
TY1B-BRQ12193 TIM44YIL022W 1296 nt15.01□□□□□ -0.01
TY1B-BRQ12193 DIF1YLR437C 402 nt15.01□□□□□ -0.01
TY1B-BRQ12193 HXT12YIL170W 1374 nt14.96□□□□□ -0.01
TY1B-BRQ12193 THI72YOR192C 1800 nt14.95□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 YAR028WYAR028W 705 nt14.95□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 GAP1YKR039W 1809 nt14.94□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 FCY21YER060W 1587 nt14.94□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 VRG4YGL225W 1014 nt14.93□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 ARP6YLR085C 1317 nt14.9□□□□□ -0.02
TY1B-BRQ12193 YCL074WYCL074W 927 nt14.88□□□□□ -0.03
TY1B-BRQ12193 CCT5YJR064W 1689 nt14.88□□□□□ -0.03
TY1B-BRQ12193 STP3YLR375W 1032 nt14.86□□□□□ -0.03
TY1B-BRQ12193 HSP60YLR259C 1719 nt14.86□□□□□ -0.03
TY1B-BRQ12193 MTG2YHR168W 1557 nt14.85□□□□□ -0.03
TY1B-BRQ12193 RIB1YBL033C 1038 nt14.82□□□□□ -0.04
TY1B-BRQ12193 PLB1YMR008C 1995 nt14.82□□□□□ -0.04
TY1B-BRQ12193 POP2YNR052C 1302 nt14.81□□□□□ -0.04
TY1B-BRQ12193 ALP1YNL270C 1722 nt14.79□□□□□ -0.04
TY1B-BRQ12193 RTN2YDL204W 1182 nt14.77□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 YJL118WYJL118W 660 nt14.77□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 UTR1YJR049C 1593 nt14.75□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 SOD2YHR008C 702 nt14.73□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 SNZ1YMR096W 894 nt14.72□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 YER152W-AYER152W-A 567 nt14.71□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 MEP3YPR138C 1470 nt14.71□□□□□ -0.05
TY1B-BRQ12193 QDR2YIL121W 1629 nt14.68□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YMR262WYMR262W 942 nt14.66□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.65□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.65□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.65□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.65□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.65□□□□□ -0.06
TY1B-BRQ12193 APS2YJR058C 444 nt14.64□□□□□ -0.07
TY1B-BRQ12193 YIA6YIL006W 1122 nt14.62□□□□□ -0.07
TY1B-BRQ12193 GAL3YDR009W 1563 nt14.62□□□□□ -0.07
TY1B-BRQ12193 SED1YDR077W 1017 nt14.62□□□□□ -0.07
TY1B-BRQ12193 TAF13YML098W 504 nt14.61□□□□□ -0.07
TY1B-BRQ12193 LSB5YCL034W 1065 nt14.57□□□□□ -0.08
TY1B-BRQ12193 PAR32YDL173W 888 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1B-BRQ12193 YPL251WYPL251W 303 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1B-BRQ12193 PRM5YIL117C 957 nt14.55□□□□□ -0.08
TY1B-BRQ12193 TUB4YLR212C 1422 nt14.54□□□□□ -0.08
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