Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 TOM6YOR045W 186 nt10.79□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 STR3YGL184C 1398 nt10.78□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 SAM1YLR180W 1149 nt10.78□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 RAD23YEL037C 1197 nt10.77□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 LSC2YGR244C 1284 nt10.77□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 POM34YLR018C 900 nt10.76□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 PEX2YJL210W 816 nt10.75□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 TSC10YBR265W 963 nt10.74□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 NRT1YOR071C 1797 nt10.74□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 HIP1YGR191W 1812 nt10.72□□□□□ -0.69
HFI1Q12060 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.7□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.7□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 ATG15YCR068W 1563 nt10.7□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 PRO1YDR300C 1287 nt10.7□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 MET28YIR017C 564 nt10.7□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 YGR012WYGR012W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 TIF6YPR016C 738 nt10.65□□□□□ -0.7
HFI1Q12060 ARP6YLR085C 1317 nt10.63□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 FIT3YOR383C 615 nt10.63□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 RIB3YDR487C 627 nt10.62□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 RTN2YDL204W 1182 nt10.61□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.61□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 FUR4YBR021W 1902 nt10.59□□□□□ -0.71
HFI1Q12060 BOR1YNL275W 1731 nt10.58□□□□□ -0.72
HFI1Q12060 GAP1YKR039W 1809 nt10.58□□□□□ -0.72
HFI1Q12060 YLR279WYLR279W 390 nt10.57□□□□□ -0.72
HFI1Q12060 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.55□□□□□ -0.72
HFI1Q12060 PLB1YMR008C 1995 nt10.5□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 CAB5YDR196C 726 nt10.5□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 HSP60YLR259C 1719 nt10.5□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 MSB4YOL112W 1479 nt10.49□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 YAR028WYAR028W 705 nt10.46□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 STE4YOR212W 1272 nt10.46□□□□□ -0.73
HFI1Q12060 YGR259CYGR259C 441 nt10.45□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 YPI1YFR003C 468 nt10.44□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 ALP1YNL270C 1722 nt10.44□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 FUN14YAL008W 597 nt10.43□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 YJL195CYJL195C 702 nt10.43□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 YKR005CYKR005C 1578 nt10.43□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 DIF1YLR437C 402 nt10.42□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 LOT5YKL183W 921 nt10.41□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 RAD51YER095W 1203 nt10.4□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 GND1YHR183W 1470 nt10.4□□□□□ -0.74
HFI1Q12060 AKR2YOR034C 2250 nt10.4□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 SAM35YHR083W 990 nt10.38□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 ADH1YOL086C 1047 nt10.38□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 UTR1YJR049C 1593 nt10.37□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 BMT6YLR063W 1098 nt10.37□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 YLR349WYLR349W 507 nt10.37□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 ADH7YCR105W 1086 nt10.35□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 YNR029CYNR029C 1290 nt10.35□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 ZTA1YBR046C 1005 nt10.35□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 PRP4YPR178W 1398 nt10.35□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 MTG2YHR168W 1557 nt10.34□□□□□ -0.75
HFI1Q12060 AAC1YMR056C 930 nt10.31□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 PAU15YIR041W 375 nt10.3□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 UME6YDR207C 2511 nt10.29□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 APT2YDR441C 546 nt10.28□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 YEL008WYEL008W 381 nt10.28□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 RPM1RPM1 483 nt10.28□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 SMM1YNR015W 1155 nt10.28□□□□□ -0.76
HFI1Q12060 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.26□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 SED1YDR077W 1017 nt10.26□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 DPS1YLL018C 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 FCY21YER060W 1587 nt10.25□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 GPN2YOR262W 1044 nt10.23□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 ALG12YNR030W 1656 nt10.22□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 CPD1YGR247W 720 nt10.22□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 PRM5YIL117C 957 nt10.22□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 IRC24YIR036C 792 nt10.22□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 NME1NME1 340 nt10.21□□□□□ -0.77
HFI1Q12060 LIP1YMR298W 453 nt10.19□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.18□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 RIB2YOL066C 1776 nt10.17□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 PRY1YJL079C 900 nt10.17□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 VRG4YGL225W 1014 nt10.15□□□□□ -0.78
HFI1Q12060 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.14□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 UGA4YDL210W 1716 nt10.13□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 HXT12YIL170W 1374 nt10.13□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 ALD4YOR374W 1560 nt10.11□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 HXT1YHR094C 1713 nt10.1□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 ESS1YJR017C 513 nt10.09□□□□□ -0.79
HFI1Q12060 DBP1YPL119C 1854 nt10.07□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 MEP3YPR138C 1470 nt10.07□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 SNF1YDR477W 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 MCH5YOR306C 1566 nt10.06□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 YPL251WYPL251W 303 nt10.06□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 BRR1YPR057W 1026 nt10.06□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 TOA2YKL058W 369 nt10.05□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 YJL055WYJL055W 738 nt10.04□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 YBL086CYBL086C 1401 nt10.04□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 LSB5YCL034W 1065 nt10.03□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 LEU9YOR108W 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
HFI1Q12060 YMR103CYMR103C 363 nt10.02□□□□□ -0.81
HFI1Q12060 BIO5YNR056C 1686 nt10.02□□□□□ -0.81
HFI1Q12060 HIF1YLL022C 1158 nt10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.4 ms