Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ST3GAL4Q11206 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ST3GAL4Q11206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ST3GAL4Q11206 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ST3GAL4Q11206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ST3GAL4Q11206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ST3GAL4Q11206 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ST3GAL4Q11206 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ST3GAL4Q11206 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ST3GAL4Q11206 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ST3GAL4Q11206 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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