Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 BIO5YNR056C 1686 nt9.26□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 PHO89YBR296C 1725 nt9.23□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 RET2YFR051C 1641 nt9.23□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 ESBP6YNL125C 2022 nt9.22□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 NPP1YCR026C 2229 nt9.21□□□□□ -0.93
FMP40Q08968 NBP35YGL091C 987 nt9.21□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 YGL034CYGL034C 366 nt9.2□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 NDI1YML120C 1542 nt9.2□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 YCR087WYCR087W 516 nt9.18□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 XYL2YLR070C 1071 nt9.18□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.17□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 RTN2YDL204W 1182 nt9.16□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 TIR3YIL011W 810 nt9.16□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 SFP1YLR403W 2052 nt9.16□□□□□ -0.94
FMP40Q08968 MRP20YDR405W 792 nt9.14□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 YAT1YAR035W 2064 nt9.14□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 MET2YNL277W 1461 nt9.14□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 SFA1YDL168W 1161 nt9.13□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 RFC1YOR217W 2586 nt9.13□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 SHH4YLR164W 507 nt9.12□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 RBG1YAL036C 1110 nt9.11□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 SBA1YKL117W 651 nt9.1□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 AIM45YPR004C 1035 nt9.1□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 COQ2YNR041C 1119 nt9.09□□□□□ -0.95
FMP40Q08968 PRO1YDR300C 1287 nt9.07□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 LSC2YGR244C 1284 nt9.07□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 ARP6YLR085C 1317 nt9.06□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 TOM6YOR045W 186 nt9.06□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 POM34YLR018C 900 nt9.05□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 ATG15YCR068W 1563 nt9.04□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 YML089CYML089C 369 nt9.04□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 PLB1YMR008C 1995 nt9.04□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 ILV2YMR108W 2064 nt9.03□□□□□ -0.96
FMP40Q08968 PEX2YJL210W 816 nt9.02□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 RPL4BYDR012W 1089 nt9.01□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 CLB6YGR109C 1143 nt9.01□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 RPL4AYBR031W 1089 nt9.01□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 DTR1YBR180W 1719 nt9.01□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 GAP1YKR039W 1809 nt9.01□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 SPT20YOL148C 1815 nt8.98□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 GLR1YPL091W 1452 nt8.98□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 UTH1YKR042W 1098 nt8.97□□□□□ -0.97
FMP40Q08968 RIM8YGL045W 1629 nt8.96□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 HIP1YGR191W 1812 nt8.96□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 MAE1YKL029C 2010 nt8.95□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 NRT1YOR071C 1797 nt8.94□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 RPS14BYJL191W 417 nt8.93□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 TIF6YPR016C 738 nt8.93□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 MET28YIR017C 564 nt8.92□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 SDH5YOL071W 489 nt8.92□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 UTR1YJR049C 1593 nt8.91□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 YGL114WYGL114W 2178 nt8.91□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 YMR244WYMR244W 1068 nt8.91□□□□□ -0.98
FMP40Q08968 SAM35YHR083W 990 nt8.89□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 GTB1YDR221W 2109 nt8.89□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 PRM5YIL117C 957 nt8.88□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 HMG2YLR450W 3138 nt8.88□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 ALD4YOR374W 1560 nt8.86□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 HIF1YLL022C 1158 nt8.86□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 YLR111WYLR111W 333 nt8.85□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 DIF1YLR437C 402 nt8.85□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 TSC10YBR265W 963 nt8.84□□□□□ -0.99
FMP40Q08968 FIT3YOR383C 615 nt8.83□□□□□ -1
FMP40Q08968 YAR028WYAR028W 705 nt8.82□□□□□ -1
FMP40Q08968 HEM14YER014W 1620 nt8.82□□□□□ -1
FMP40Q08968 TPO4YOR273C 1980 nt8.8□□□□□ -1
FMP40Q08968 YGR012WYGR012W 1182 nt8.79□□□□□ -1
FMP40Q08968 INA1YLR413W 2028 nt8.78□□□□□ -1
FMP40Q08968 YMR226CYMR226C 804 nt8.78□□□□□ -1
FMP40Q08968 AKR2YOR034C 2250 nt8.78□□□□□ -1
FMP40Q08968 RBG2YGR173W 1107 nt8.77□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 TOK1YJL093C 2076 nt8.76□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 RAD23YEL037C 1197 nt8.76□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 UGA4YDL210W 1716 nt8.75□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 YLR279WYLR279W 390 nt8.75□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 ACO2YJL200C 2370 nt8.75□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 ALP1YNL270C 1722 nt8.74□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 ZTA1YBR046C 1005 nt8.74□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 RPC82YPR190C 1965 nt8.73□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 GAL2YLR081W 1725 nt8.73□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 MTG2YHR168W 1557 nt8.73□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 SED1YDR077W 1017 nt8.72□□□□□ -1.01
FMP40Q08968 URA8YJR103W 1737 nt8.71□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 MSB4YOL112W 1479 nt8.7□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 ZRT3YKL175W 1512 nt8.7□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 LIP1YMR298W 453 nt8.7□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.69□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.69□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.69□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.69□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.69□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 HXT1YHR094C 1713 nt8.68□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 MUP1YGR055W 1725 nt8.67□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.67□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 DBP1YPL119C 1854 nt8.66□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 RIB3YDR487C 627 nt8.65□□□□□ -1.02
FMP40Q08968 NME1NME1 340 nt8.64□□□□□ -1.03
FMP40Q08968 CAB5YDR196C 726 nt8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms