Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIGFQ07326 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIGFQ07326 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIGFQ07326 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIGFQ07326 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIGFQ07326 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIGFQ07326 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGFQ07326 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIGFQ07326 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIGFQ07326 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms