Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
ERCC6Q03468 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
ERCC6Q03468 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC48.82■■■■■ 5.41
ERCC6Q03468 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC48.75■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC48.75■■■■■ 5.4
ERCC6Q03468 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC48.73■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
ERCC6Q03468 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC48.68■■■■■ 5.38
ERCC6Q03468 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
ERCC6Q03468 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
ERCC6Q03468 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC48.61■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC48.59■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ERCC6Q03468 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC48.55■■■■■ 5.36
ERCC6Q03468 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ERCC6Q03468 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC48.53■■■■■ 5.36
ERCC6Q03468 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
ERCC6Q03468 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC48.52■■■■■ 5.36
ERCC6Q03468 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
ERCC6Q03468 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
ERCC6Q03468 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
ERCC6Q03468 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
ERCC6Q03468 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC48.38■■■■■ 5.34
ERCC6Q03468 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC48.38■■■■■ 5.34
ERCC6Q03468 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
ERCC6Q03468 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC48.33■■■■■ 5.33
ERCC6Q03468 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
ERCC6Q03468 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
ERCC6Q03468 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC48.31■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC48.28■■■■■ 5.32
ERCC6Q03468 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC48.23■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC48.19■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
ERCC6Q03468 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.14■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC48.14■■■■■ 5.3
ERCC6Q03468 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
ERCC6Q03468 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
ERCC6Q03468 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
ERCC6Q03468 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
ERCC6Q03468 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
ERCC6Q03468 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
ERCC6Q03468 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.26
ERCC6Q03468 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
ERCC6Q03468 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.93■■■■■ 5.26
ERCC6Q03468 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
ERCC6Q03468 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
ERCC6Q03468 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
ERCC6Q03468 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ERCC6Q03468 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
ERCC6Q03468 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
ERCC6Q03468 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
ERCC6Q03468 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms