Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARDQ03181 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARDQ03181 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARDQ03181 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPARDQ03181 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPARDQ03181 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPARDQ03181 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARDQ03181 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPARDQ03181 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms