Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD83Q01151 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD83Q01151 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD83Q01151 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD83Q01151 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD83Q01151 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD83Q01151 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD83Q01151 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD83Q01151 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD83Q01151 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD83Q01151 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD83Q01151 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD83Q01151 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD83Q01151 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD83Q01151 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD83Q01151 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD83Q01151 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD83Q01151 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD83Q01151 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD83Q01151 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD83Q01151 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD83Q01151 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD83Q01151 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD83Q01151 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD83Q01151 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD83Q01151 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD83Q01151 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD83Q01151 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD83Q01151 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD83Q01151 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD83Q01151 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD83Q01151 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD83Q01151 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD83Q01151 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD83Q01151 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD83Q01151 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD83Q01151 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD83Q01151 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD83Q01151 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD83Q01151 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD83Q01151 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD83Q01151 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD83Q01151 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD83Q01151 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD83Q01151 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD83Q01151 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD83Q01151 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD83Q01151 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD83Q01151 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD83Q01151 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD83Q01151 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD83Q01151 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD83Q01151 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD83Q01151 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD83Q01151 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD83Q01151 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD83Q01151 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD83Q01151 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD83Q01151 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD83Q01151 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD83Q01151 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD83Q01151 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD83Q01151 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD83Q01151 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD83Q01151 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD83Q01151 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD83Q01151 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD83Q01151 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD83Q01151 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD83Q01151 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD83Q01151 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD83Q01151 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD83Q01151 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD83Q01151 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD83Q01151 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD83Q01151 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD83Q01151 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD83Q01151 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD83Q01151 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD83Q01151 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD83Q01151 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD83Q01151 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CD83Q01151 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD83Q01151 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD83Q01151 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD83Q01151 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD83Q01151 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD83Q01151 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD83Q01151 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD83Q01151 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD83Q01151 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD83Q01151 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD83Q01151 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD83Q01151 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD83Q01151 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms