Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HBBP68871 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HBBP68871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HBBP68871 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HBBP68871 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HBBP68871 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HBBP68871 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HBBP68871 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HBBP68871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HBBP68871 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HBBP68871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HBBP68871 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HBBP68871 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HBBP68871 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HBBP68871 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HBBP68871 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HBBP68871 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HBBP68871 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HBBP68871 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HBBP68871 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HBBP68871 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HBBP68871 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HBBP68871 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HBBP68871 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HBBP68871 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HBBP68871 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HBBP68871 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HBBP68871 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HBBP68871 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBBP68871 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBBP68871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HBBP68871 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBBP68871 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBBP68871 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBBP68871 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HBBP68871 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBBP68871 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBBP68871 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBBP68871 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBBP68871 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBBP68871 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBBP68871 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBBP68871 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBBP68871 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBBP68871 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBBP68871 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HBBP68871 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HBBP68871 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HBBP68871 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HBBP68871 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBBP68871 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBBP68871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBBP68871 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HBBP68871 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBBP68871 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HBBP68871 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBBP68871 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBBP68871 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBBP68871 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HBBP68871 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBBP68871 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HBBP68871 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBBP68871 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HBBP68871 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HBBP68871 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HBBP68871 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBBP68871 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HBBP68871 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HBBP68871 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBBP68871 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBBP68871 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HBBP68871 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HBBP68871 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HBBP68871 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HBBP68871 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HBBP68871 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HBBP68871 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HBBP68871 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HBBP68871 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HBBP68871 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HBBP68871 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HBBP68871 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HBBP68871 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HBBP68871 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HBBP68871 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HBBP68871 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HBBP68871 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HBBP68871 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HBBP68871 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HBBP68871 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms