Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA4AP68366 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBA4AP68366 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA4AP68366 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA4AP68366 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA4AP68366 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA4AP68366 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA4AP68366 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms