Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN5P62079 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN5P62079 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN5P62079 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN5P62079 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN5P62079 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN5P62079 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN5P62079 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms