Protein–RNA interactions for Protein: P61916

NPC2, Epididymal secretory protein E1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC2P61916 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPC2P61916 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPC2P61916 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPC2P61916 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPC2P61916 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPC2P61916 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPC2P61916 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPC2P61916 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPC2P61916 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPC2P61916 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPC2P61916 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPC2P61916 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPC2P61916 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPC2P61916 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPC2P61916 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPC2P61916 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPC2P61916 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPC2P61916 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPC2P61916 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPC2P61916 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPC2P61916 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPC2P61916 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPC2P61916 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPC2P61916 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPC2P61916 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPC2P61916 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPC2P61916 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPC2P61916 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPC2P61916 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPC2P61916 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPC2P61916 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPC2P61916 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPC2P61916 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPC2P61916 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPC2P61916 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPC2P61916 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPC2P61916 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPC2P61916 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPC2P61916 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPC2P61916 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPC2P61916 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPC2P61916 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPC2P61916 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPC2P61916 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPC2P61916 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPC2P61916 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPC2P61916 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPC2P61916 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPC2P61916 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPC2P61916 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPC2P61916 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPC2P61916 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPC2P61916 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPC2P61916 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPC2P61916 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPC2P61916 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPC2P61916 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPC2P61916 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPC2P61916 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPC2P61916 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPC2P61916 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPC2P61916 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPC2P61916 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPC2P61916 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPC2P61916 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPC2P61916 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPC2P61916 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NPC2P61916 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPC2P61916 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPC2P61916 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPC2P61916 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPC2P61916 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPC2P61916 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPC2P61916 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPC2P61916 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPC2P61916 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPC2P61916 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPC2P61916 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPC2P61916 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPC2P61916 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPC2P61916 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPC2P61916 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPC2P61916 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPC2P61916 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms