Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2MP61081 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2MP61081 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2MP61081 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2MP61081 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2MP61081 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE2MP61081 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2MP61081 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms