Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX9P55771 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAX9P55771 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX9P55771 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX9P55771 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAX9P55771 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX9P55771 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX9P55771 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAX9P55771 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAX9P55771 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAX9P55771 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX9P55771 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAX9P55771 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAX9P55771 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAX9P55771 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX9P55771 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAX9P55771 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX9P55771 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX9P55771 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAX9P55771 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX9P55771 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX9P55771 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX9P55771 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAX9P55771 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX9P55771 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAX9P55771 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX9P55771 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAX9P55771 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAX9P55771 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX9P55771 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX9P55771 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX9P55771 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PAX9P55771 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX9P55771 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX9P55771 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PAX9P55771 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PAX9P55771 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX9P55771 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX9P55771 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAX9P55771 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX9P55771 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX9P55771 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX9P55771 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAX9P55771 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAX9P55771 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAX9P55771 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAX9P55771 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX9P55771 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAX9P55771 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX9P55771 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAX9P55771 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX9P55771 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAX9P55771 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX9P55771 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX9P55771 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX9P55771 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAX9P55771 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX9P55771 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX9P55771 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAX9P55771 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX9P55771 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX9P55771 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAX9P55771 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAX9P55771 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX9P55771 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX9P55771 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX9P55771 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAX9P55771 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX9P55771 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX9P55771 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAX9P55771 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX9P55771 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX9P55771 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX9P55771 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX9P55771 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX9P55771 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX9P55771 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX9P55771 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX9P55771 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX9P55771 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX9P55771 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX9P55771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX9P55771 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX9P55771 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX9P55771 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX9P55771 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX9P55771 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX9P55771 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX9P55771 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX9P55771 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX9P55771 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX9P55771 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX9P55771 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX9P55771 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX9P55771 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX9P55771 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX9P55771 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX9P55771 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX9P55771 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX9P55771 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms