Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ELLP55199 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ELLP55199 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELLP55199 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELLP55199 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELLP55199 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELLP55199 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELLP55199 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ELLP55199 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELLP55199 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELLP55199 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELLP55199 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELLP55199 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELLP55199 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELLP55199 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELLP55199 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELLP55199 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELLP55199 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELLP55199 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELLP55199 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ELLP55199 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELLP55199 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELLP55199 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELLP55199 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELLP55199 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELLP55199 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELLP55199 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ELLP55199 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ELLP55199 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELLP55199 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELLP55199 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELLP55199 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELLP55199 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELLP55199 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELLP55199 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELLP55199 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ELLP55199 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ELLP55199 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELLP55199 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ELLP55199 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELLP55199 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ELLP55199 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELLP55199 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELLP55199 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELLP55199 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ELLP55199 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELLP55199 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELLP55199 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELLP55199 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ELLP55199 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELLP55199 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELLP55199 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELLP55199 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELLP55199 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELLP55199 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELLP55199 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELLP55199 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELLP55199 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELLP55199 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELLP55199 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELLP55199 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELLP55199 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELLP55199 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELLP55199 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELLP55199 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELLP55199 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELLP55199 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELLP55199 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ELLP55199 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELLP55199 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ELLP55199 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ELLP55199 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELLP55199 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELLP55199 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ELLP55199 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ELLP55199 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELLP55199 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ELLP55199 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELLP55199 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELLP55199 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ELLP55199 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELLP55199 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ELLP55199 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELLP55199 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELLP55199 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELLP55199 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELLP55199 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ELLP55199 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELLP55199 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELLP55199 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELLP55199 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELLP55199 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ELLP55199 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELLP55199 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ELLP55199 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ELLP55199 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELLP55199 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELLP55199 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELLP55199 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ELLP55199 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms