Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 PAU16YKL224C 372 nt9.36□□□□□ -0.91
SNF12P53628 VPS75YNL246W 795 nt9.36□□□□□ -0.91
SNF12P53628 RIM8YGL045W 1629 nt9.35□□□□□ -0.91
SNF12P53628 INA1YLR413W 2028 nt9.35□□□□□ -0.91
SNF12P53628 ALD4YOR374W 1560 nt9.33□□□□□ -0.92
SNF12P53628 UTR1YJR049C 1593 nt9.32□□□□□ -0.92
SNF12P53628 RPC82YPR190C 1965 nt9.32□□□□□ -0.92
SNF12P53628 SHH4YLR164W 507 nt9.29□□□□□ -0.92
SNF12P53628 GAP1YKR039W 1809 nt9.26□□□□□ -0.93
SNF12P53628 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.25□□□□□ -0.93
SNF12P53628 TIR3YIL011W 810 nt9.24□□□□□ -0.93
SNF12P53628 YGL114WYGL114W 2178 nt9.24□□□□□ -0.93
SNF12P53628 LSC2YGR244C 1284 nt9.23□□□□□ -0.93
SNF12P53628 MIR1YJR077C 936 nt9.22□□□□□ -0.93
SNF12P53628 PRO1YDR300C 1287 nt9.21□□□□□ -0.94
SNF12P53628 PAU7YAR020C 168 nt9.19□□□□□ -0.94
SNF12P53628 MUP1YGR055W 1725 nt9.18□□□□□ -0.94
SNF12P53628 POM34YLR018C 900 nt9.18□□□□□ -0.94
SNF12P53628 ZRT3YKL175W 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
SNF12P53628 MAE1YKL029C 2010 nt9.15□□□□□ -0.94
SNF12P53628 MET2YNL277W 1461 nt9.15□□□□□ -0.95
SNF12P53628 THI74YDR438W 1113 nt9.14□□□□□ -0.95
SNF12P53628 SHB17YKR043C 816 nt9.14□□□□□ -0.95
SNF12P53628 NAT4YMR069W 858 nt9.14□□□□□ -0.95
SNF12P53628 YDR010CYDR010C 333 nt9.13□□□□□ -0.95
SNF12P53628 SAM35YHR083W 990 nt9.13□□□□□ -0.95
SNF12P53628 YJL067WYJL067W 351 nt9.12□□□□□ -0.95
SNF12P53628 GID7YCL039W 2238 nt9.12□□□□□ -0.95
SNF12P53628 ATG15YCR068W 1563 nt9.12□□□□□ -0.95
SNF12P53628 DBP1YPL119C 1854 nt9.11□□□□□ -0.95
SNF12P53628 SFA1YDL168W 1161 nt9.11□□□□□ -0.95
SNF12P53628 MSF1YPR047W 1410 nt9.11□□□□□ -0.95
SNF12P53628 DIF1YLR437C 402 nt9.1□□□□□ -0.95
SNF12P53628 UBA4YHR111W 1323 nt9.09□□□□□ -0.95
SNF12P53628 TOM6YOR045W 186 nt9.08□□□□□ -0.96
SNF12P53628 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.07□□□□□ -0.96
SNF12P53628 YML089CYML089C 369 nt9.07□□□□□ -0.96
SNF12P53628 RET2YFR051C 1641 nt9.05□□□□□ -0.96
SNF12P53628 HXT1YHR094C 1713 nt9.05□□□□□ -0.96
SNF12P53628 HOL1YNR055C 1761 nt9.04□□□□□ -0.96
SNF12P53628 SHY1YGR112W 1170 nt9.02□□□□□ -0.97
SNF12P53628 YSR3YKR053C 1215 nt9.02□□□□□ -0.97
SNF12P53628 PHO89YBR296C 1725 nt9□□□□□ -0.97
SNF12P53628 TIF6YPR016C 738 nt9□□□□□ -0.97
SNF12P53628 ESBP6YNL125C 2022 nt9□□□□□ -0.97
SNF12P53628 NPP1YCR026C 2229 nt9□□□□□ -0.97
SNF12P53628 ACO2YJL200C 2370 nt8.99□□□□□ -0.97
SNF12P53628 YBL086CYBL086C 1401 nt8.98□□□□□ -0.97
SNF12P53628 YGL034CYGL034C 366 nt8.98□□□□□ -0.97
SNF12P53628 SFP1YLR403W 2052 nt8.97□□□□□ -0.97
SNF12P53628 PEX2YJL210W 816 nt8.97□□□□□ -0.97
SNF12P53628 YOR325WYOR325W 474 nt8.97□□□□□ -0.97
SNF12P53628 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.96□□□□□ -0.98
SNF12P53628 ILV3YJR016C 1758 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YCR087WYCR087W 516 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF12P53628 XYL2YLR070C 1071 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF12P53628 HIP1YGR191W 1812 nt8.95□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YMR209CYMR209C 1374 nt8.93□□□□□ -0.98
SNF12P53628 MCM5YLR274W 2328 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YAR028WYAR028W 705 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 LIP1YMR298W 453 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 YNL024CYNL024C 741 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 COQ2YNR041C 1119 nt8.92□□□□□ -0.98
SNF12P53628 UFO1YML088W 2007 nt8.91□□□□□ -0.98
SNF12P53628 MTG2YHR168W 1557 nt8.9□□□□□ -0.98
SNF12P53628 SED1YDR077W 1017 nt8.9□□□□□ -0.98
SNF12P53628 MRP20YDR405W 792 nt8.89□□□□□ -0.99
SNF12P53628 URA6YKL024C 615 nt8.89□□□□□ -0.99
SNF12P53628 AIM45YPR004C 1035 nt8.89□□□□□ -0.99
SNF12P53628 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.88□□□□□ -0.99
SNF12P53628 LEU9YOR108W 1815 nt8.87□□□□□ -0.99
SNF12P53628 YGR139WYGR139W 339 nt8.87□□□□□ -0.99
SNF12P53628 HIS2YFR025C 1008 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF12P53628 MET28YIR017C 564 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF12P53628 SBA1YKL117W 651 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF12P53628 ZTA1YBR046C 1005 nt8.86□□□□□ -0.99
SNF12P53628 HEM14YER014W 1620 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF12P53628 MAS1YLR163C 1389 nt8.85□□□□□ -0.99
SNF12P53628 RBG1YAL036C 1110 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF12P53628 YPL251WYPL251W 303 nt8.84□□□□□ -0.99
SNF12P53628 OPI10YOL032W 741 nt8.83□□□□□ -1
SNF12P53628 RFC1YOR217W 2586 nt8.82□□□□□ -1
SNF12P53628 COQ8YGL119W 1506 nt8.82□□□□□ -1
SNF12P53628 CWC15YDR163W 528 nt8.82□□□□□ -1
SNF12P53628 UGA4YDL210W 1716 nt8.81□□□□□ -1
SNF12P53628 RPL4BYDR012W 1089 nt8.81□□□□□ -1
SNF12P53628 SAM1YLR180W 1149 nt8.81□□□□□ -1
SNF12P53628 RPL4AYBR031W 1089 nt8.81□□□□□ -1
SNF12P53628 BRR1YPR057W 1026 nt8.81□□□□□ -1
SNF12P53628 AKR2YOR034C 2250 nt8.8□□□□□ -1
SNF12P53628 ARO8YGL202W 1503 nt8.8□□□□□ -1
SNF12P53628 DTR1YBR180W 1719 nt8.8□□□□□ -1
SNF12P53628 TOA2YKL058W 369 nt8.8□□□□□ -1
SNF12P53628 OYE3YPL171C 1203 nt8.8□□□□□ -1
SNF12P53628 CCT2YIL142W 1584 nt8.8□□□□□ -1
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