Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 TIR3YIL011W 810 nt11.05□□□□□ -0.64
LSC2P53312 IRC24YIR036C 792 nt11.05□□□□□ -0.64
LSC2P53312 MSF1YPR047W 1410 nt11.04□□□□□ -0.64
LSC2P53312 NAT4YMR069W 858 nt11.02□□□□□ -0.65
LSC2P53312 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.01□□□□□ -0.65
LSC2P53312 PRO1YDR300C 1287 nt11□□□□□ -0.65
LSC2P53312 PHO89YBR296C 1725 nt11□□□□□ -0.65
LSC2P53312 POM34YLR018C 900 nt10.99□□□□□ -0.65
LSC2P53312 YSR3YKR053C 1215 nt10.98□□□□□ -0.65
LSC2P53312 Q0010Q0010 387 nt10.98□□□□□ -0.65
LSC2P53312 UME6YDR207C 2511 nt10.98□□□□□ -0.65
LSC2P53312 YJL225CYJL225C 5277 nt10.97□□□□□ -0.65
LSC2P53312 LSC2YGR244C 1284 nt10.95□□□□□ -0.66
LSC2P53312 XYL2YLR070C 1071 nt10.95□□□□□ -0.66
LSC2P53312 COQ2YNR041C 1119 nt10.95□□□□□ -0.66
LSC2P53312 TOM6YOR045W 186 nt10.95□□□□□ -0.66
LSC2P53312 YGL034CYGL034C 366 nt10.93□□□□□ -0.66
LSC2P53312 PRM5YIL117C 957 nt10.93□□□□□ -0.66
LSC2P53312 GAP1YKR039W 1809 nt10.93□□□□□ -0.66
LSC2P53312 UTR1YJR049C 1593 nt10.92□□□□□ -0.66
LSC2P53312 PBP1YGR178C 2169 nt10.92□□□□□ -0.66
LSC2P53312 MCH5YOR306C 1566 nt10.91□□□□□ -0.66
LSC2P53312 Q0144Q0144 330 nt10.9□□□□□ -0.66
LSC2P53312 ATG15YCR068W 1563 nt10.88□□□□□ -0.67
LSC2P53312 PEX2YJL210W 816 nt10.86□□□□□ -0.67
LSC2P53312 NAR1YNL240C 1476 nt10.86□□□□□ -0.67
LSC2P53312 TIF6YPR016C 738 nt10.84□□□□□ -0.67
LSC2P53312 HIP1YGR191W 1812 nt10.84□□□□□ -0.67
LSC2P53312 YML089CYML089C 369 nt10.83□□□□□ -0.68
LSC2P53312 ARA2YMR041C 1008 nt10.83□□□□□ -0.68
LSC2P53312 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.82□□□□□ -0.68
LSC2P53312 SRN2YLR119W 642 nt10.82□□□□□ -0.68
LSC2P53312 AIM45YPR004C 1035 nt10.82□□□□□ -0.68
LSC2P53312 YCR087WYCR087W 516 nt10.8□□□□□ -0.68
LSC2P53312 HIF1YLL022C 1158 nt10.8□□□□□ -0.68
LSC2P53312 MRP20YDR405W 792 nt10.79□□□□□ -0.68
LSC2P53312 DIF1YLR437C 402 nt10.79□□□□□ -0.68
LSC2P53312 SEM1YDR363W-A 270 nt10.78□□□□□ -0.68
LSC2P53312 CYT2YKL087C 675 nt10.77□□□□□ -0.69
LSC2P53312 RBG1YAL036C 1110 nt10.76□□□□□ -0.69
LSC2P53312 ALD4YOR374W 1560 nt10.73□□□□□ -0.69
LSC2P53312 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.73□□□□□ -0.69
LSC2P53312 RPS14BYJL191W 417 nt10.73□□□□□ -0.69
LSC2P53312 SBA1YKL117W 651 nt10.72□□□□□ -0.69
LSC2P53312 RPL4BYDR012W 1089 nt10.71□□□□□ -0.69
LSC2P53312 RPL4AYBR031W 1089 nt10.71□□□□□ -0.69
LSC2P53312 YLR122CYLR122C 378 nt10.68□□□□□ -0.7
LSC2P53312 MET8YBR213W 825 nt10.68□□□□□ -0.7
LSC2P53312 NDI1YML120C 1542 nt10.68□□□□□ -0.7
LSC2P53312 NRT1YOR071C 1797 nt10.67□□□□□ -0.7
LSC2P53312 MET28YIR017C 564 nt10.67□□□□□ -0.7
LSC2P53312 UTH1YKR042W 1098 nt10.67□□□□□ -0.7
LSC2P53312 YAT1YAR035W 2064 nt10.66□□□□□ -0.7
LSC2P53312 ABZ2YMR289W 1125 nt10.66□□□□□ -0.7
LSC2P53312 ZTA1YBR046C 1005 nt10.66□□□□□ -0.7
LSC2P53312 MTG2YHR168W 1557 nt10.65□□□□□ -0.71
LSC2P53312 DBP1YPL119C 1854 nt10.64□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YAR028WYAR028W 705 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.63□□□□□ -0.71
LSC2P53312 CLB6YGR109C 1143 nt10.62□□□□□ -0.71
LSC2P53312 SAM35YHR083W 990 nt10.61□□□□□ -0.71
LSC2P53312 ARP10YDR106W 855 nt10.58□□□□□ -0.72
LSC2P53312 YBL086CYBL086C 1401 nt10.57□□□□□ -0.72
LSC2P53312 CAB5YDR196C 726 nt10.56□□□□□ -0.72
LSC2P53312 AKR2YOR034C 2250 nt10.56□□□□□ -0.72
LSC2P53312 HXT1YHR094C 1713 nt10.55□□□□□ -0.72
LSC2P53312 YLR279WYLR279W 390 nt10.54□□□□□ -0.72
LSC2P53312 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
LSC2P53312 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.54□□□□□ -0.72
LSC2P53312 SED1YDR077W 1017 nt10.53□□□□□ -0.72
LSC2P53312 FIT3YOR383C 615 nt10.52□□□□□ -0.73
LSC2P53312 MSB4YOL112W 1479 nt10.52□□□□□ -0.73
LSC2P53312 GLR1YPL091W 1452 nt10.51□□□□□ -0.73
LSC2P53312 LIP1YMR298W 453 nt10.51□□□□□ -0.73
LSC2P53312 YPL251WYPL251W 303 nt10.51□□□□□ -0.73
LSC2P53312 ALP1YNL270C 1722 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 SHY1YGR112W 1170 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 YMR244WYMR244W 1068 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 TSC10YBR265W 963 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.5□□□□□ -0.73
LSC2P53312 YGR012WYGR012W 1182 nt10.49□□□□□ -0.73
LSC2P53312 SDH5YOL071W 489 nt10.47□□□□□ -0.73
LSC2P53312 YJL067WYJL067W 351 nt10.46□□□□□ -0.73
LSC2P53312 ZRT3YKL175W 1512 nt10.46□□□□□ -0.74
LSC2P53312 UFO1YML088W 2007 nt10.45□□□□□ -0.74
LSC2P53312 LEU9YOR108W 1815 nt10.44□□□□□ -0.74
LSC2P53312 RPC82YPR190C 1965 nt10.44□□□□□ -0.74
LSC2P53312 UGA4YDL210W 1716 nt10.41□□□□□ -0.74
LSC2P53312 BRR1YPR057W 1026 nt10.41□□□□□ -0.74
LSC2P53312 PET20YPL159C 762 nt10.38□□□□□ -0.75
LSC2P53312 SAM1YLR180W 1149 nt10.37□□□□□ -0.75
LSC2P53312 RAD23YEL037C 1197 nt10.36□□□□□ -0.75
LSC2P53312 TOA2YKL058W 369 nt10.36□□□□□ -0.75
LSC2P53312 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.36□□□□□ -0.75
LSC2P53312 YMR103CYMR103C 363 nt10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms