Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMAN1P49257 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMAN1P49257 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMAN1P49257 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMAN1P49257 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMAN1P49257 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMAN1P49257 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LMAN1P49257 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMAN1P49257 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms