Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 YEL008WYEL008W 381 nt12.54□□□□□ -0.4
CTH1P47976 AVT6YER119C 1347 nt12.51□□□□□ -0.41
CTH1P47976 NAP1YKR048C 1254 nt12.5□□□□□ -0.41
CTH1P47976 TSC10YBR265W 963 nt12.5□□□□□ -0.41
CTH1P47976 UTH1YKR042W 1098 nt12.47□□□□□ -0.41
CTH1P47976 SHH4YLR164W 507 nt12.46□□□□□ -0.41
CTH1P47976 HHO1YPL127C 777 nt12.46□□□□□ -0.41
CTH1P47976 YGR201CYGR201C 678 nt12.45□□□□□ -0.42
CTH1P47976 YCR102CYCR102C 1107 nt12.43□□□□□ -0.42
CTH1P47976 YJR114WYJR114W 393 nt12.43□□□□□ -0.42
CTH1P47976 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.41□□□□□ -0.42
CTH1P47976 PEX2YJL210W 816 nt12.41□□□□□ -0.42
CTH1P47976 TOM6YOR045W 186 nt12.41□□□□□ -0.42
CTH1P47976 YPI1YFR003C 468 nt12.39□□□□□ -0.43
CTH1P47976 DUT1YBR252W 444 nt12.37□□□□□ -0.43
CTH1P47976 AAC1YMR056C 930 nt12.36□□□□□ -0.43
CTH1P47976 HIP1YGR191W 1812 nt12.36□□□□□ -0.43
CTH1P47976 MSB4YOL112W 1479 nt12.35□□□□□ -0.43
CTH1P47976 GOR1YNL274C 1053 nt12.35□□□□□ -0.43
CTH1P47976 NRT1YOR071C 1797 nt12.35□□□□□ -0.43
CTH1P47976 SWE1YJL187C 2460 nt12.34□□□□□ -0.43
CTH1P47976 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.32□□□□□ -0.44
CTH1P47976 RAX1YOR301W 1308 nt12.32□□□□□ -0.44
CTH1P47976 PGC1YPL206C 966 nt12.3□□□□□ -0.44
CTH1P47976 LOT5YKL183W 921 nt12.28□□□□□ -0.44
CTH1P47976 YJL064WYJL064W 396 nt12.27□□□□□ -0.45
CTH1P47976 TIR3YIL011W 810 nt12.26□□□□□ -0.45
CTH1P47976 PAU5YFL020C 369 nt12.25□□□□□ -0.45
CTH1P47976 BOR1YNL275W 1731 nt12.25□□□□□ -0.45
CTH1P47976 YBR232CYBR232C 360 nt12.24□□□□□ -0.45
CTH1P47976 SLG1YOR008C 1137 nt12.23□□□□□ -0.45
CTH1P47976 GND1YHR183W 1470 nt12.22□□□□□ -0.45
CTH1P47976 POM34YLR018C 900 nt12.22□□□□□ -0.45
CTH1P47976 APT2YDR441C 546 nt12.21□□□□□ -0.45
CTH1P47976 NBP35YGL091C 987 nt12.21□□□□□ -0.45
CTH1P47976 PAU19YMR325W 375 nt12.19□□□□□ -0.46
CTH1P47976 TIM44YIL022W 1296 nt12.18□□□□□ -0.46
CTH1P47976 MET28YIR017C 564 nt12.18□□□□□ -0.46
CTH1P47976 TIF6YPR016C 738 nt12.17□□□□□ -0.46
CTH1P47976 AGP1YCL025C 1902 nt12.16□□□□□ -0.46
CTH1P47976 ERG6YML008C 1152 nt12.14□□□□□ -0.47
CTH1P47976 PRO1YDR300C 1287 nt12.13□□□□□ -0.47
CTH1P47976 RIB1YBL033C 1038 nt12.11□□□□□ -0.47
CTH1P47976 HSP60YLR259C 1719 nt12.11□□□□□ -0.47
CTH1P47976 RIB2YOL066C 1776 nt12.1□□□□□ -0.47
CTH1P47976 STP3YLR375W 1032 nt12.09□□□□□ -0.47
CTH1P47976 YML089CYML089C 369 nt12.09□□□□□ -0.47
CTH1P47976 SMM1YNR015W 1155 nt12.05□□□□□ -0.48
CTH1P47976 ATG15YCR068W 1563 nt12.05□□□□□ -0.48
CTH1P47976 FIT3YOR383C 615 nt12.04□□□□□ -0.48
CTH1P47976 SOD2YHR008C 702 nt12.01□□□□□ -0.49
CTH1P47976 CCA1YER168C 1641 nt12□□□□□ -0.49
CTH1P47976 LSB3YFR024C-A 1380 nt12□□□□□ -0.49
CTH1P47976 ALD4YOR374W 1560 nt11.99□□□□□ -0.49
CTH1P47976 FUR4YBR021W 1902 nt11.98□□□□□ -0.49
CTH1P47976 TIP1YBR067C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
CTH1P47976 LSC2YGR244C 1284 nt11.96□□□□□ -0.49
CTH1P47976 UME6YDR207C 2511 nt11.91□□□□□ -0.5
CTH1P47976 YIA6YIL006W 1122 nt11.91□□□□□ -0.5
CTH1P47976 AQY2YLL052C 450 nt11.9□□□□□ -0.5
CTH1P47976 ZTA1YBR046C 1005 nt11.89□□□□□ -0.51
CTH1P47976 BMT6YLR063W 1098 nt11.87□□□□□ -0.51
CTH1P47976 Q0182Q0182 405 nt11.86□□□□□ -0.51
CTH1P47976 YJL225CYJL225C 5277 nt11.85□□□□□ -0.51
CTH1P47976 HXT12YIL170W 1374 nt11.84□□□□□ -0.51
CTH1P47976 QDR2YIL121W 1629 nt11.84□□□□□ -0.51
CTH1P47976 STR3YGL184C 1398 nt11.83□□□□□ -0.52
CTH1P47976 ALG12YNR030W 1656 nt11.83□□□□□ -0.52
CTH1P47976 VRG4YGL225W 1014 nt11.82□□□□□ -0.52
CTH1P47976 FCY21YER060W 1587 nt11.82□□□□□ -0.52
CTH1P47976 POP2YNR052C 1302 nt11.81□□□□□ -0.52
CTH1P47976 YER152W-AYER152W-A 567 nt11.8□□□□□ -0.52
CTH1P47976 YJL055WYJL055W 738 nt11.8□□□□□ -0.52
CTH1P47976 CCT5YJR064W 1689 nt11.8□□□□□ -0.52
CTH1P47976 PRY1YJL079C 900 nt11.79□□□□□ -0.52
CTH1P47976 DUS1YML080W 1272 nt11.79□□□□□ -0.52
CTH1P47976 AKR2YOR034C 2250 nt11.78□□□□□ -0.52
CTH1P47976 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.78□□□□□ -0.52
CTH1P47976 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.78□□□□□ -0.52
CTH1P47976 ALP1YNL270C 1722 nt11.77□□□□□ -0.52
CTH1P47976 PRP4YPR178W 1398 nt11.77□□□□□ -0.53
CTH1P47976 GAP1YKR039W 1809 nt11.76□□□□□ -0.53
CTH1P47976 MTG2YHR168W 1557 nt11.73□□□□□ -0.53
CTH1P47976 MCH5YOR306C 1566 nt11.73□□□□□ -0.53
CTH1P47976 DPS1YLL018C 1674 nt11.71□□□□□ -0.53
CTH1P47976 ARP6YLR085C 1317 nt11.71□□□□□ -0.53
CTH1P47976 YAR028WYAR028W 705 nt11.71□□□□□ -0.53
CTH1P47976 THI72YOR192C 1800 nt11.7□□□□□ -0.54
CTH1P47976 BUD20YLR074C 501 nt11.69□□□□□ -0.54
CTH1P47976 TAF13YML098W 504 nt11.69□□□□□ -0.54
CTH1P47976 YMR262WYMR262W 942 nt11.68□□□□□ -0.54
CTH1P47976 UGA4YDL210W 1716 nt11.67□□□□□ -0.54
CTH1P47976 PAR32YDL173W 888 nt11.67□□□□□ -0.54
CTH1P47976 YKR005CYKR005C 1578 nt11.67□□□□□ -0.54
CTH1P47976 DIF1YLR437C 402 nt11.65□□□□□ -0.54
CTH1P47976 TUB4YLR212C 1422 nt11.63□□□□□ -0.55
CTH1P47976 SNF1YDR477W 1902 nt11.61□□□□□ -0.55
CTH1P47976 YCL074WYCL074W 927 nt11.61□□□□□ -0.55
CTH1P47976 KRE1YNL322C 942 nt11.59□□□□□ -0.55
CTH1P47976 SAM50YNL026W 1455 nt11.58□□□□□ -0.56
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