Protein–RNA interactions for Protein: P40453

UBP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,071 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP7P40453 DUS1YML080W 1272 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP7P40453 YGR259CYGR259C 441 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP7P40453 YMR226CYMR226C 804 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP7P40453 NBP35YGL091C 987 nt10.24□□□□□ -0.77
UBP7P40453 PBP1YGR178C 2169 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP7P40453 TIR3YIL011W 810 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP7P40453 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.21□□□□□ -0.77
UBP7P40453 RPL4BYDR012W 1089 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP7P40453 IRC24YIR036C 792 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP7P40453 RPL4AYBR031W 1089 nt10.2□□□□□ -0.78
UBP7P40453 CYT2YKL087C 675 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP7P40453 SHH4YLR164W 507 nt10.16□□□□□ -0.78
UBP7P40453 STR3YGL184C 1398 nt10.15□□□□□ -0.78
UBP7P40453 CLB6YGR109C 1143 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP7P40453 RPS14BYJL191W 417 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP7P40453 LSC2YGR244C 1284 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP7P40453 POM34YLR018C 900 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP7P40453 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP7P40453 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP7P40453 YML089CYML089C 369 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP7P40453 UTH1YKR042W 1098 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP7P40453 YLR111WYLR111W 333 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP7P40453 TOM6YOR045W 186 nt10.08□□□□□ -0.8
UBP7P40453 HIP1YGR191W 1812 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP7P40453 FRE6YLL051C 2139 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP7P40453 AQY2YLL052C 450 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP7P40453 RAD23YEL037C 1197 nt10.06□□□□□ -0.8
UBP7P40453 SAM1YLR180W 1149 nt10.05□□□□□ -0.8
UBP7P40453 ARP6YLR085C 1317 nt10.04□□□□□ -0.8
UBP7P40453 PEX2YJL210W 816 nt10.03□□□□□ -0.8
UBP7P40453 PRO1YDR300C 1287 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP7P40453 SDH5YOL071W 489 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP7P40453 TSC10YBR265W 963 nt10.02□□□□□ -0.81
UBP7P40453 TIF6YPR016C 738 nt10.01□□□□□ -0.81
UBP7P40453 NRT1YOR071C 1797 nt10.01□□□□□ -0.81
UBP7P40453 MET28YIR017C 564 nt10□□□□□ -0.81
UBP7P40453 CMP2YML057W 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
UBP7P40453 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.99□□□□□ -0.81
UBP7P40453 ATG15YCR068W 1563 nt9.97□□□□□ -0.81
UBP7P40453 RTN2YDL204W 1182 nt9.97□□□□□ -0.81
UBP7P40453 YGR012WYGR012W 1182 nt9.97□□□□□ -0.81
UBP7P40453 RIB3YDR487C 627 nt9.95□□□□□ -0.82
UBP7P40453 YAT1YAR035W 2064 nt9.94□□□□□ -0.82
UBP7P40453 CAB5YDR196C 726 nt9.93□□□□□ -0.82
UBP7P40453 FIT3YOR383C 615 nt9.93□□□□□ -0.82
UBP7P40453 GAP1YKR039W 1809 nt9.92□□□□□ -0.82
UBP7P40453 YLR279WYLR279W 390 nt9.92□□□□□ -0.82
UBP7P40453 PLB1YMR008C 1995 nt9.86□□□□□ -0.83
UBP7P40453 HSL7YBR133C 2484 nt9.84□□□□□ -0.83
UBP7P40453 MSB4YOL112W 1479 nt9.84□□□□□ -0.83
UBP7P40453 DIF1YLR437C 402 nt9.81□□□□□ -0.84
UBP7P40453 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.81□□□□□ -0.84
UBP7P40453 YAR028WYAR028W 705 nt9.79□□□□□ -0.84
UBP7P40453 ALP1YNL270C 1722 nt9.76□□□□□ -0.85
UBP7P40453 RAD51YER095W 1203 nt9.76□□□□□ -0.85
UBP7P40453 HIF1YLL022C 1158 nt9.75□□□□□ -0.85
UBP7P40453 UTR1YJR049C 1593 nt9.75□□□□□ -0.85
UBP7P40453 SPT20YOL148C 1815 nt9.75□□□□□ -0.85
UBP7P40453 YPI1YFR003C 468 nt9.74□□□□□ -0.85
UBP7P40453 FUN14YAL008W 597 nt9.74□□□□□ -0.85
UBP7P40453 GND1YHR183W 1470 nt9.73□□□□□ -0.85
UBP7P40453 MTG2YHR168W 1557 nt9.73□□□□□ -0.85
UBP7P40453 ADH1YOL086C 1047 nt9.73□□□□□ -0.85
UBP7P40453 STE4YOR212W 1272 nt9.73□□□□□ -0.85
UBP7P40453 YLR349WYLR349W 507 nt9.72□□□□□ -0.85
UBP7P40453 ALD4YOR374W 1560 nt9.71□□□□□ -0.85
UBP7P40453 PRM5YIL117C 957 nt9.71□□□□□ -0.86
UBP7P40453 YJL195CYJL195C 702 nt9.71□□□□□ -0.86
UBP7P40453 ZTA1YBR046C 1005 nt9.71□□□□□ -0.86
UBP7P40453 RPC82YPR190C 1965 nt9.71□□□□□ -0.86
UBP7P40453 INA1YLR413W 2028 nt9.7□□□□□ -0.86
UBP7P40453 LOT5YKL183W 921 nt9.69□□□□□ -0.86
UBP7P40453 AKR2YOR034C 2250 nt9.69□□□□□ -0.86
UBP7P40453 YNR029CYNR029C 1290 nt9.67□□□□□ -0.86
UBP7P40453 FCY21YER060W 1587 nt9.67□□□□□ -0.86
UBP7P40453 SAM35YHR083W 990 nt9.65□□□□□ -0.86
UBP7P40453 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP7P40453 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.64□□□□□ -0.87
UBP7P40453 APT2YDR441C 546 nt9.63□□□□□ -0.87
UBP7P40453 SED1YDR077W 1017 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP7P40453 YEL008WYEL008W 381 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP7P40453 SMM1YNR015W 1155 nt9.6□□□□□ -0.87
UBP7P40453 ADH7YCR105W 1086 nt9.57□□□□□ -0.88
UBP7P40453 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.55□□□□□ -0.88
UBP7P40453 HXT12YIL170W 1374 nt9.55□□□□□ -0.88
UBP7P40453 ZRT3YKL175W 1512 nt9.54□□□□□ -0.88
UBP7P40453 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 DBP1YPL119C 1854 nt9.53□□□□□ -0.88
UBP7P40453 UGA4YDL210W 1716 nt9.52□□□□□ -0.89
UBP7P40453 PAU15YIR041W 375 nt9.52□□□□□ -0.89
UBP7P40453 PRY1YJL079C 900 nt9.52□□□□□ -0.89
UBP7P40453 LIP1YMR298W 453 nt9.52□□□□□ -0.89
UBP7P40453 HEL2YDR266C 1920 nt9.49□□□□□ -0.89
UBP7P40453 CPD1YGR247W 720 nt9.49□□□□□ -0.89
UBP7P40453 RIB2YOL066C 1776 nt9.49□□□□□ -0.89
UBP7P40453 RIM8YGL045W 1629 nt9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.4 ms