Protein–RNA interactions for Protein: P40042

RRT13, Regulator of rDNA transcription protein 13, yeastyeast

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT13P40042 MIR1YJR077C 936 nt7.43□□□□□ -1.22
RRT13P40042 PAU16YKL224C 372 nt7.43□□□□□ -1.22
RRT13P40042 NDI1YML120C 1542 nt7.42□□□□□ -1.22
RRT13P40042 UBX6YJL048C 1191 nt7.41□□□□□ -1.22
RRT13P40042 GAP1YKR039W 1809 nt7.41□□□□□ -1.22
RRT13P40042 PRO1YDR300C 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
RRT13P40042 POM34YLR018C 900 nt7.4□□□□□ -1.22
RRT13P40042 PRM5YIL117C 957 nt7.39□□□□□ -1.23
RRT13P40042 RET2YFR051C 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
RRT13P40042 UTR1YJR049C 1593 nt7.38□□□□□ -1.23
RRT13P40042 NPP1YCR026C 2229 nt7.38□□□□□ -1.23
RRT13P40042 SFA1YDL168W 1161 nt7.38□□□□□ -1.23
RRT13P40042 UBA4YHR111W 1323 nt7.37□□□□□ -1.23
RRT13P40042 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.37□□□□□ -1.23
RRT13P40042 THI74YDR438W 1113 nt7.36□□□□□ -1.23
RRT13P40042 YML089CYML089C 369 nt7.36□□□□□ -1.23
RRT13P40042 ALD4YOR374W 1560 nt7.36□□□□□ -1.23
RRT13P40042 GID7YCL039W 2238 nt7.36□□□□□ -1.23
RRT13P40042 ATG15YCR068W 1563 nt7.35□□□□□ -1.23
RRT13P40042 HIF1YLL022C 1158 nt7.35□□□□□ -1.23
RRT13P40042 MAE1YKL029C 2010 nt7.35□□□□□ -1.23
RRT13P40042 PHO89YBR296C 1725 nt7.35□□□□□ -1.23
RRT13P40042 TOM6YOR045W 186 nt7.33□□□□□ -1.24
RRT13P40042 SAM35YHR083W 990 nt7.32□□□□□ -1.24
RRT13P40042 YSR3YKR053C 1215 nt7.32□□□□□ -1.24
RRT13P40042 NAT4YMR069W 858 nt7.32□□□□□ -1.24
RRT13P40042 MSF1YPR047W 1410 nt7.3□□□□□ -1.24
RRT13P40042 RIM8YGL045W 1629 nt7.29□□□□□ -1.24
RRT13P40042 HMG2YLR450W 3138 nt7.28□□□□□ -1.24
RRT13P40042 DIF1YLR437C 402 nt7.28□□□□□ -1.24
RRT13P40042 COQ2YNR041C 1119 nt7.28□□□□□ -1.24
RRT13P40042 SPT20YOL148C 1815 nt7.28□□□□□ -1.24
RRT13P40042 YCR087WYCR087W 516 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 MRP20YDR405W 792 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 PEX2YJL210W 816 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 TIF6YPR016C 738 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 SSN3YPL042C 1668 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 TPO4YOR273C 1980 nt7.27□□□□□ -1.25
RRT13P40042 YGL114WYGL114W 2178 nt7.26□□□□□ -1.25
RRT13P40042 XYL2YLR070C 1071 nt7.26□□□□□ -1.25
RRT13P40042 HIP1YGR191W 1812 nt7.26□□□□□ -1.25
RRT13P40042 YGL034CYGL034C 366 nt7.24□□□□□ -1.25
RRT13P40042 UGA4YDL210W 1716 nt7.23□□□□□ -1.25
RRT13P40042 INA1YLR413W 2028 nt7.22□□□□□ -1.25
RRT13P40042 MET28YIR017C 564 nt7.22□□□□□ -1.25
RRT13P40042 ZRT3YKL175W 1512 nt7.22□□□□□ -1.25
RRT13P40042 AIM45YPR004C 1035 nt7.21□□□□□ -1.26
RRT13P40042 DBP1YPL119C 1854 nt7.21□□□□□ -1.26
RRT13P40042 RPL4BYDR012W 1089 nt7.2□□□□□ -1.26
RRT13P40042 CLB6YGR109C 1143 nt7.2□□□□□ -1.26
RRT13P40042 RPL4AYBR031W 1089 nt7.2□□□□□ -1.26
RRT13P40042 HXT1YHR094C 1713 nt7.19□□□□□ -1.26
RRT13P40042 RPC82YPR190C 1965 nt7.19□□□□□ -1.26
RRT13P40042 NRT1YOR071C 1797 nt7.19□□□□□ -1.26
RRT13P40042 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.19□□□□□ -1.26
RRT13P40042 YAR028WYAR028W 705 nt7.19□□□□□ -1.26
RRT13P40042 UTH1YKR042W 1098 nt7.18□□□□□ -1.26
RRT13P40042 ACO2YJL200C 2370 nt7.16□□□□□ -1.26
RRT13P40042 RPS14BYJL191W 417 nt7.15□□□□□ -1.26
RRT13P40042 MTG2YHR168W 1557 nt7.15□□□□□ -1.27
RRT13P40042 SED1YDR077W 1017 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 RBG1YAL036C 1110 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 LIP1YMR298W 453 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.14□□□□□ -1.27
RRT13P40042 FIT3YOR383C 615 nt7.13□□□□□ -1.27
RRT13P40042 SHY1YGR112W 1170 nt7.12□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YJL067WYJL067W 351 nt7.12□□□□□ -1.27
RRT13P40042 ALP1YNL270C 1722 nt7.12□□□□□ -1.27
RRT13P40042 YBL086CYBL086C 1401 nt7.11□□□□□ -1.27
RRT13P40042 URA8YJR103W 1737 nt7.11□□□□□ -1.27
RRT13P40042 AKR2YOR034C 2250 nt7.11□□□□□ -1.27
RRT13P40042 ZTA1YBR046C 1005 nt7.1□□□□□ -1.27
RRT13P40042 FRE6YLL051C 2139 nt7.09□□□□□ -1.28
RRT13P40042 ILV2YMR108W 2064 nt7.07□□□□□ -1.28
RRT13P40042 LEU9YOR108W 1815 nt7.07□□□□□ -1.28
RRT13P40042 SAM1YLR180W 1149 nt7.07□□□□□ -1.28
RRT13P40042 ESBP6YNL125C 2022 nt7.06□□□□□ -1.28
RRT13P40042 URA6YKL024C 615 nt7.05□□□□□ -1.28
RRT13P40042 TSC10YBR265W 963 nt7.05□□□□□ -1.28
RRT13P40042 MUP1YGR055W 1725 nt7.04□□□□□ -1.28
RRT13P40042 TOA2YKL058W 369 nt7.04□□□□□ -1.28
RRT13P40042 YPL251WYPL251W 303 nt7.04□□□□□ -1.28
RRT13P40042 BRR1YPR057W 1026 nt7.04□□□□□ -1.28
RRT13P40042 UFO1YML088W 2007 nt7.04□□□□□ -1.28
RRT13P40042 GTB1YDR221W 2109 nt7.03□□□□□ -1.28
RRT13P40042 YLR279WYLR279W 390 nt7.02□□□□□ -1.29
RRT13P40042 SBA1YKL117W 651 nt7.01□□□□□ -1.29
RRT13P40042 SDH5YOL071W 489 nt7.01□□□□□ -1.29
RRT13P40042 GND2YGR256W 1479 nt6.99□□□□□ -1.29
RRT13P40042 YGR012WYGR012W 1182 nt6.99□□□□□ -1.29
RRT13P40042 OYE3YPL171C 1203 nt6.99□□□□□ -1.29
RRT13P40042 HOL1YNR055C 1761 nt6.98□□□□□ -1.29
RRT13P40042 TRT2tT(CGU)K 72 nt6.98□□□□□ -1.29
RRT13P40042 YMR103CYMR103C 363 nt6.98□□□□□ -1.29
RRT13P40042 PET8YNL003C 855 nt6.98□□□□□ -1.29
RRT13P40042 MSB4YOL112W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9 ms