Protein–RNA interactions for Protein: P38780

YHR054C, Uncharacterized protein YHR054C, yeastyeast

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR054CP38780 PEX2YJL210W 816 nt10.57□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 UTH1YKR042W 1098 nt10.57□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 YLR111WYLR111W 333 nt10.57□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 SDH5YOL071W 489 nt10.57□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 PRO1YDR300C 1287 nt10.56□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 LSC2YGR244C 1284 nt10.55□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 YML089CYML089C 369 nt10.55□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
YHR054CP38780 HIP1YGR191W 1812 nt10.52□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 ATG15YCR068W 1563 nt10.52□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 NRT1YOR071C 1797 nt10.49□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 ARP6YLR085C 1317 nt10.49□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 RTN2YDL204W 1182 nt10.48□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 MET28YIR017C 564 nt10.46□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 TIF6YPR016C 738 nt10.46□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 TSC10YBR265W 963 nt10.46□□□□□ -0.73
YHR054CP38780 RAD23YEL037C 1197 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR054CP38780 GAP1YKR039W 1809 nt10.43□□□□□ -0.74
YHR054CP38780 YGR012WYGR012W 1182 nt10.42□□□□□ -0.74
YHR054CP38780 PLB1YMR008C 1995 nt10.41□□□□□ -0.74
YHR054CP38780 YKR005CYKR005C 1578 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 YGR259CYGR259C 441 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 SAM1YLR180W 1149 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 YLR279WYLR279W 390 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 FIT3YOR383C 615 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 HSP60YLR259C 1719 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 CAB5YDR196C 726 nt10.34□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 PRP4YPR178W 1398 nt10.34□□□□□ -0.75
YHR054CP38780 RIB3YDR487C 627 nt10.33□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 UME6YDR207C 2511 nt10.32□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 BMT6YLR063W 1098 nt10.3□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 MSB4YOL112W 1479 nt10.3□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 DIF1YLR437C 402 nt10.28□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 UTR1YJR049C 1593 nt10.27□□□□□ -0.76
YHR054CP38780 YAR028WYAR028W 705 nt10.26□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.26□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 DPS1YLL018C 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 RPM1RPM1 483 nt10.24□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 AKR2YOR034C 2250 nt10.23□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 ZTA1YBR046C 1005 nt10.22□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 ALP1YNL270C 1722 nt10.21□□□□□ -0.77
YHR054CP38780 BOR1YNL275W 1731 nt10.19□□□□□ -0.78
YHR054CP38780 SAM35YHR083W 990 nt10.19□□□□□ -0.78
YHR054CP38780 MTG2YHR168W 1557 nt10.18□□□□□ -0.78
YHR054CP38780 PRM5YIL117C 957 nt10.17□□□□□ -0.78
YHR054CP38780 IRC24YIR036C 792 nt10.16□□□□□ -0.78
YHR054CP38780 LOT5YKL183W 921 nt10.14□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 GND1YHR183W 1470 nt10.14□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 YPI1YFR003C 468 nt10.12□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 YJL195CYJL195C 702 nt10.11□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 AAC1YMR056C 930 nt10.11□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 SED1YDR077W 1017 nt10.1□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 ADH1YOL086C 1047 nt10.1□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 RAD51YER095W 1203 nt10.09□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 STE4YOR212W 1272 nt10.09□□□□□ -0.79
YHR054CP38780 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 FUN14YAL008W 597 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 APT2YDR441C 546 nt10.07□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 SMM1YNR015W 1155 nt10.06□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 LIP1YMR298W 453 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 SNF1YDR477W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YNR029CYNR029C 1290 nt10.04□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 FCY21YER060W 1587 nt10.04□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 YLR349WYLR349W 507 nt10.03□□□□□ -0.8
YHR054CP38780 ALD4YOR374W 1560 nt10.02□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.01□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 UGA4YDL210W 1716 nt10□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 HXT1YHR094C 1713 nt9.99□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 PRY1YJL079C 900 nt9.98□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 ADH7YCR105W 1086 nt9.97□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 DBP1YPL119C 1854 nt9.96□□□□□ -0.81
YHR054CP38780 HIF1YLL022C 1158 nt9.96□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 YPL251WYPL251W 303 nt9.95□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 YBL086CYBL086C 1401 nt9.95□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 RIB2YOL066C 1776 nt9.95□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 YEL008WYEL008W 381 nt9.94□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 PAU15YIR041W 375 nt9.94□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 GPN2YOR262W 1044 nt9.93□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 BRR1YPR057W 1026 nt9.93□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 MEP3YPR138C 1470 nt9.92□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 TOA2YKL058W 369 nt9.92□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 VRG4YGL225W 1014 nt9.91□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 YMR103CYMR103C 363 nt9.91□□□□□ -0.82
YHR054CP38780 HXT12YIL170W 1374 nt9.89□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 BIO5YNR056C 1686 nt9.89□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 LEU9YOR108W 1815 nt9.89□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 CPD1YGR247W 720 nt9.87□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 YJL055WYJL055W 738 nt9.87□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 GND2YGR256W 1479 nt9.85□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 MCH5YOR306C 1566 nt9.84□□□□□ -0.83
YHR054CP38780 SHY1YGR112W 1170 nt9.83□□□□□ -0.84
YHR054CP38780 CSM1YCR086W 573 nt9.82□□□□□ -0.84
YHR054CP38780 SSN3YPL042C 1668 nt9.81□□□□□ -0.84
YHR054CP38780 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.81□□□□□ -0.84
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