Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LIPAP38571 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPAP38571 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIPAP38571 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPAP38571 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPAP38571 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIPAP38571 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIPAP38571 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIPAP38571 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPAP38571 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPAP38571 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPAP38571 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPAP38571 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIPAP38571 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIPAP38571 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIPAP38571 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPAP38571 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIPAP38571 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIPAP38571 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPAP38571 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPAP38571 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPAP38571 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIPAP38571 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPAP38571 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIPAP38571 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPAP38571 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPAP38571 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPAP38571 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIPAP38571 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIPAP38571 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIPAP38571 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIPAP38571 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPAP38571 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIPAP38571 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPAP38571 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIPAP38571 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPAP38571 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIPAP38571 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIPAP38571 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIPAP38571 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIPAP38571 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LIPAP38571 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPAP38571 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPAP38571 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPAP38571 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPAP38571 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIPAP38571 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPAP38571 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPAP38571 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIPAP38571 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPAP38571 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIPAP38571 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPAP38571 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LIPAP38571 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIPAP38571 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIPAP38571 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LIPAP38571 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPAP38571 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPAP38571 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPAP38571 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPAP38571 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LIPAP38571 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPAP38571 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LIPAP38571 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIPAP38571 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPAP38571 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPAP38571 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIPAP38571 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIPAP38571 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LIPAP38571 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LIPAP38571 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIPAP38571 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIPAP38571 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIPAP38571 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIPAP38571 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIPAP38571 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPAP38571 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPAP38571 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPAP38571 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIPAP38571 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIPAP38571 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIPAP38571 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPAP38571 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPAP38571 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIPAP38571 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIPAP38571 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIPAP38571 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIPAP38571 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPAP38571 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPAP38571 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIPAP38571 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIPAP38571 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIPAP38571 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPAP38571 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIPAP38571 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms