Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFBR1P36897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBR1P36897 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFBR1P36897 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGFBR1P36897 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGFBR1P36897 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGFBR1P36897 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGFBR1P36897 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGFBR1P36897 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms