Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGM1P36871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PGM1P36871 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PGM1P36871 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGM1P36871 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGM1P36871 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGM1P36871 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PGM1P36871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGM1P36871 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGM1P36871 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PGM1P36871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGM1P36871 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGM1P36871 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGM1P36871 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PGM1P36871 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGM1P36871 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PGM1P36871 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGM1P36871 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PGM1P36871 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PGM1P36871 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGM1P36871 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGM1P36871 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGM1P36871 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGM1P36871 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGM1P36871 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGM1P36871 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGM1P36871 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGM1P36871 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGM1P36871 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGM1P36871 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGM1P36871 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGM1P36871 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGM1P36871 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGM1P36871 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGM1P36871 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGM1P36871 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGM1P36871 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGM1P36871 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGM1P36871 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGM1P36871 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGM1P36871 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PGM1P36871 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGM1P36871 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGM1P36871 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PGM1P36871 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGM1P36871 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGM1P36871 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGM1P36871 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PGM1P36871 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PGM1P36871 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGM1P36871 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PGM1P36871 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PGM1P36871 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGM1P36871 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGM1P36871 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGM1P36871 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PGM1P36871 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGM1P36871 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PGM1P36871 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PGM1P36871 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGM1P36871 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PGM1P36871 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGM1P36871 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGM1P36871 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGM1P36871 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGM1P36871 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGM1P36871 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PGM1P36871 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM1P36871 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM1P36871 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM1P36871 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM1P36871 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGM1P36871 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PGM1P36871 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGM1P36871 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGM1P36871 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGM1P36871 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM1P36871 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM1P36871 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGM1P36871 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGM1P36871 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGM1P36871 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGM1P36871 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGM1P36871 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGM1P36871 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGM1P36871 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGM1P36871 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGM1P36871 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGM1P36871 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGM1P36871 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms