Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC7A1P30825 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC7A1P30825 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC7A1P30825 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC7A1P30825 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC7A1P30825 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC7A1P30825 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC7A1P30825 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC7A1P30825 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC7A1P30825 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC7A1P30825 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC7A1P30825 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms