Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL12P30050 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL12P30050 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL12P30050 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL12P30050 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL12P30050 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL12P30050 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL12P30050 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL12P30050 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL12P30050 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL12P30050 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL12P30050 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL12P30050 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL12P30050 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL12P30050 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL12P30050 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL12P30050 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL12P30050 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL12P30050 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL12P30050 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL12P30050 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL12P30050 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL12P30050 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL12P30050 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL12P30050 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL12P30050 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL12P30050 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL12P30050 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL12P30050 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL12P30050 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL12P30050 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL12P30050 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL12P30050 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL12P30050 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL12P30050 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL12P30050 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL12P30050 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL12P30050 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL12P30050 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL12P30050 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL12P30050 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL12P30050 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL12P30050 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL12P30050 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL12P30050 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL12P30050 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL12P30050 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL12P30050 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL12P30050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL12P30050 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL12P30050 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL12P30050 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL12P30050 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL12P30050 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL12P30050 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL12P30050 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL12P30050 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL12P30050 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL12P30050 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL12P30050 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL12P30050 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL12P30050 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL12P30050 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL12P30050 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL12P30050 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL12P30050 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL12P30050 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL12P30050 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL12P30050 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL12P30050 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL12P30050 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL12P30050 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL12P30050 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL12P30050 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL12P30050 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL12P30050 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL12P30050 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL12P30050 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL12P30050 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL12P30050 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL12P30050 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL12P30050 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL12P30050 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL12P30050 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL12P30050 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL12P30050 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL12P30050 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL12P30050 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL12P30050 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL12P30050 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL12P30050 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL12P30050 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL12P30050 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL12P30050 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL12P30050 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL12P30050 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL12P30050 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL12P30050 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL12P30050 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL12P30050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms