Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNA4P22459 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA4P22459 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNA4P22459 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNA4P22459 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA4P22459 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNA4P22459 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA4P22459 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA4P22459 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA4P22459 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA4P22459 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA4P22459 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms