Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCMT1P22061 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCMT1P22061 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCMT1P22061 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCMT1P22061 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMT1P22061 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCMT1P22061 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCMT1P22061 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCMT1P22061 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms