Protein–RNA interactions for Protein: P0CX35

RPS4A, 40S ribosomal protein S4-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS4AP0CX35 NAR1YNL240C 1476 nt9.78□□□□□ -0.84
RPS4AP0CX35 XYL2YLR070C 1071 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS4AP0CX35 PHO89YBR296C 1725 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS4AP0CX35 SFA1YDL168W 1161 nt9.72□□□□□ -0.85
RPS4AP0CX35 PLB1YMR008C 1995 nt9.72□□□□□ -0.85
RPS4AP0CX35 SHH4YLR164W 507 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 REG2YBR050C 1017 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 ARP6YLR085C 1317 nt9.68□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 YCR087WYCR087W 516 nt9.67□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 COQ2YNR041C 1119 nt9.67□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 PBP1YGR178C 2169 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 CLB6YGR109C 1143 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 RBG1YAL036C 1110 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 CYT2YKL087C 675 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 AIM45YPR004C 1035 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS4AP0CX35 TIR3YIL011W 810 nt9.64□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 NDI1YML120C 1542 nt9.63□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 PAM17YKR065C 594 nt9.63□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 PRM5YIL117C 957 nt9.62□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 MRP20YDR405W 792 nt9.61□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 YMR244WYMR244W 1068 nt9.61□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 GLR1YPL091W 1452 nt9.59□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 PRO1YDR300C 1287 nt9.59□□□□□ -0.87
RPS4AP0CX35 LSC2YGR244C 1284 nt9.58□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 POM34YLR018C 900 nt9.58□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 GAP1YKR039W 1809 nt9.57□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 TOM6YOR045W 186 nt9.57□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 UTR1YJR049C 1593 nt9.57□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 ATG15YCR068W 1563 nt9.54□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 ALD4YOR374W 1560 nt9.54□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 HIF1YLL022C 1158 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 RPM1RPM1 483 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS4AP0CX35 RPL4BYDR012W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 RPL4AYBR031W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.52□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.52□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 HIP1YGR191W 1812 nt9.52□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 PEX2YJL210W 816 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 YML089CYML089C 369 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 RPS14BYJL191W 417 nt9.49□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 SAM35YHR083W 990 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS4AP0CX35 TIF6YPR016C 738 nt9.46□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 YAT1YAR035W 2064 nt9.45□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 UTH1YKR042W 1098 nt9.45□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 RBG2YGR173W 1107 nt9.43□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 DIF1YLR437C 402 nt9.41□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 NRT1YOR071C 1797 nt9.4□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 MET28YIR017C 564 nt9.4□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 ARA2YMR041C 1008 nt9.4□□□□□ -0.9
RPS4AP0CX35 YMR226CYMR226C 804 nt9.37□□□□□ -0.91
RPS4AP0CX35 SDH5YOL071W 489 nt9.35□□□□□ -0.91
RPS4AP0CX35 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
RPS4AP0CX35 TSC10YBR265W 963 nt9.34□□□□□ -0.91
RPS4AP0CX35 CAB5YDR196C 726 nt9.33□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 BUR6YER159C 429 nt9.33□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YLR122CYLR122C 378 nt9.33□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 HXT1YHR094C 1713 nt9.32□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YGR012WYGR012W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YLR111WYLR111W 333 nt9.32□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 Q0010Q0010 387 nt9.31□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 ZRT3YKL175W 1512 nt9.31□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 RAD23YEL037C 1197 nt9.3□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YLR279WYLR279W 390 nt9.3□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 DBP1YPL119C 1854 nt9.3□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 INA1YLR413W 2028 nt9.29□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YAR028WYAR028W 705 nt9.29□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 FIT3YOR383C 615 nt9.29□□□□□ -0.92
RPS4AP0CX35 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.27□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 MSB4YOL112W 1479 nt9.27□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 LIP1YMR298W 453 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.26□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 RPC82YPR190C 1965 nt9.25□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 SED1YDR077W 1017 nt9.25□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 MTG2YHR168W 1557 nt9.24□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 AKR2YOR034C 2250 nt9.24□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 ZTA1YBR046C 1005 nt9.24□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 RIB3YDR487C 627 nt9.23□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 SHY1YGR112W 1170 nt9.23□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YJL067WYJL067W 351 nt9.23□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 ABZ2YMR289W 1125 nt9.23□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 YBL086CYBL086C 1401 nt9.22□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 SPT20YOL148C 1815 nt9.22□□□□□ -0.93
RPS4AP0CX35 ALP1YNL270C 1722 nt9.2□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 LCP5YER127W 1074 nt9.18□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 SAM1YLR180W 1149 nt9.18□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 BMT5YIL096C 1011 nt9.17□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 TOA2YKL058W 369 nt9.15□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.15□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 YPL251WYPL251W 303 nt9.15□□□□□ -0.94
RPS4AP0CX35 TOM20YGR082W 552 nt9.13□□□□□ -0.95
RPS4AP0CX35 BRR1YPR057W 1026 nt9.13□□□□□ -0.95
RPS4AP0CX35 URH1YDR400W 1023 nt9.12□□□□□ -0.95
RPS4AP0CX35 YJR154WYJR154W 1041 nt9.12□□□□□ -0.95
RPS4AP0CX35 LEU9YOR108W 1815 nt9.1□□□□□ -0.95
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