Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTA3P0C7M3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTA3P0C7M3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SFTA3P0C7M3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFTA3P0C7M3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFTA3P0C7M3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFTA3P0C7M3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFTA3P0C7M3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFTA3P0C7M3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms