Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB5P09067 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXB5P09067 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXB5P09067 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXB5P09067 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB5P09067 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB5P09067 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB5P09067 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms