Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPSAP08865 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPSAP08865 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPSAP08865 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPSAP08865 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPSAP08865 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPSAP08865 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPSAP08865 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPSAP08865 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPSAP08865 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPSAP08865 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPSAP08865 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPSAP08865 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPSAP08865 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPSAP08865 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPSAP08865 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPSAP08865 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPSAP08865 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPSAP08865 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPSAP08865 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPSAP08865 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPSAP08865 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPSAP08865 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPSAP08865 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPSAP08865 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPSAP08865 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPSAP08865 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPSAP08865 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPSAP08865 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPSAP08865 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPSAP08865 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPSAP08865 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPSAP08865 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPSAP08865 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPSAP08865 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPSAP08865 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPSAP08865 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPSAP08865 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPSAP08865 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPSAP08865 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPSAP08865 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPSAP08865 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPSAP08865 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPSAP08865 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPSAP08865 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPSAP08865 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPSAP08865 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPSAP08865 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPSAP08865 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPSAP08865 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPSAP08865 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPSAP08865 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPSAP08865 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPSAP08865 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPSAP08865 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPSAP08865 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPSAP08865 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPSAP08865 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPSAP08865 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPSAP08865 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPSAP08865 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPSAP08865 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPSAP08865 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPSAP08865 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPSAP08865 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPSAP08865 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPSAP08865 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPSAP08865 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPSAP08865 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPSAP08865 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPSAP08865 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPSAP08865 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPSAP08865 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPSAP08865 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPSAP08865 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPSAP08865 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPSAP08865 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPSAP08865 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPSAP08865 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPSAP08865 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPSAP08865 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPSAP08865 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPSAP08865 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPSAP08865 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPSAP08865 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPSAP08865 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPSAP08865 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPSAP08865 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPSAP08865 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPSAP08865 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPSAP08865 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPSAP08865 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPSAP08865 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPSAP08865 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPSAP08865 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms