Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LYNP07948 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LYNP07948 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LYNP07948 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LYNP07948 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LYNP07948 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LYNP07948 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LYNP07948 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYNP07948 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYNP07948 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYNP07948 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LYNP07948 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LYNP07948 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LYNP07948 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LYNP07948 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LYNP07948 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LYNP07948 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LYNP07948 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LYNP07948 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LYNP07948 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LYNP07948 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LYNP07948 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LYNP07948 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LYNP07948 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LYNP07948 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LYNP07948 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LYNP07948 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LYNP07948 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LYNP07948 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LYNP07948 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LYNP07948 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LYNP07948 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LYNP07948 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LYNP07948 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LYNP07948 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LYNP07948 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LYNP07948 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LYNP07948 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LYNP07948 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LYNP07948 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LYNP07948 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LYNP07948 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LYNP07948 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LYNP07948 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LYNP07948 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LYNP07948 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LYNP07948 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LYNP07948 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LYNP07948 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LYNP07948 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LYNP07948 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LYNP07948 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LYNP07948 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LYNP07948 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYNP07948 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LYNP07948 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LYNP07948 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LYNP07948 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LYNP07948 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYNP07948 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYNP07948 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYNP07948 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYNP07948 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LYNP07948 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LYNP07948 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LYNP07948 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LYNP07948 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LYNP07948 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYNP07948 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYNP07948 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYNP07948 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYNP07948 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LYNP07948 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LYNP07948 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LYNP07948 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LYNP07948 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYNP07948 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LYNP07948 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYNP07948 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYNP07948 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYNP07948 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LYNP07948 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYNP07948 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYNP07948 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LYNP07948 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYNP07948 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYNP07948 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYNP07948 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LYNP07948 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYNP07948 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYNP07948 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYNP07948 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LYNP07948 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYNP07948 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYNP07948 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LYNP07948 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYNP07948 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LYNP07948 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LYNP07948 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LYNP07948 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms