Protein–RNA interactions for Protein: P01583

IL1A, Interleukin-1 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1AP01583 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IL1AP01583 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IL1AP01583 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IL1AP01583 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IL1AP01583 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1AP01583 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IL1AP01583 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1AP01583 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IL1AP01583 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL1AP01583 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IL1AP01583 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL1AP01583 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IL1AP01583 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IL1AP01583 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1AP01583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IL1AP01583 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL1AP01583 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IL1AP01583 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL1AP01583 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IL1AP01583 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IL1AP01583 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IL1AP01583 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IL1AP01583 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1AP01583 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IL1AP01583 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IL1AP01583 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1AP01583 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1AP01583 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IL1AP01583 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IL1AP01583 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1AP01583 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IL1AP01583 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL1AP01583 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IL1AP01583 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IL1AP01583 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1AP01583 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1AP01583 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IL1AP01583 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1AP01583 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IL1AP01583 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IL1AP01583 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1AP01583 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IL1AP01583 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IL1AP01583 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IL1AP01583 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IL1AP01583 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IL1AP01583 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IL1AP01583 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IL1AP01583 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IL1AP01583 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL1AP01583 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IL1AP01583 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IL1AP01583 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IL1AP01583 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IL1AP01583 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IL1AP01583 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IL1AP01583 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IL1AP01583 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IL1AP01583 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IL1AP01583 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IL1AP01583 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IL1AP01583 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IL1AP01583 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IL1AP01583 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IL1AP01583 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL1AP01583 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL1AP01583 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL1AP01583 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IL1AP01583 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IL1AP01583 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IL1AP01583 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IL1AP01583 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IL1AP01583 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IL1AP01583 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IL1AP01583 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IL1AP01583 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IL1AP01583 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IL1AP01583 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IL1AP01583 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IL1AP01583 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IL1AP01583 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IL1AP01583 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IL1AP01583 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IL1AP01583 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IL1AP01583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IL1AP01583 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IL1AP01583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IL1AP01583 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IL1AP01583 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IL1AP01583 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IL1AP01583 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IL1AP01583 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IL1AP01583 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IL1AP01583 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IL1AP01583 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms