Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA1P01562 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA1P01562 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFNA1P01562 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA1P01562 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA1P01562 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IFNA1P01562 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA1P01562 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA1P01562 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA1P01562 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA1P01562 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA1P01562 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA1P01562 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA1P01562 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA1P01562 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA1P01562 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA1P01562 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA1P01562 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA1P01562 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA1P01562 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA1P01562 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA1P01562 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA1P01562 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
IFNA1P01562 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA1P01562 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms