Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31AO94979 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC31AO94979 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC31AO94979 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEC31AO94979 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC31AO94979 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEC31AO94979 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEC31AO94979 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31AO94979 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEC31AO94979 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEC31AO94979 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEC31AO94979 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEC31AO94979 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31AO94979 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms