Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX4O60224 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX4O60224 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX4O60224 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSX4O60224 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX4O60224 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX4O60224 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX4O60224 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX4O60224 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX4O60224 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX4O60224 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX4O60224 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX4O60224 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX4O60224 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX4O60224 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX4O60224 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX4O60224 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX4O60224 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX4O60224 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX4O60224 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSX4O60224 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX4O60224 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSX4O60224 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX4O60224 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX4O60224 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX4O60224 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSX4O60224 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX4O60224 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX4O60224 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSX4O60224 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX4O60224 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSX4O60224 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX4O60224 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX4O60224 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX4O60224 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSX4O60224 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX4O60224 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSX4O60224 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSX4O60224 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX4O60224 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSX4O60224 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX4O60224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX4O60224 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSX4O60224 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSX4O60224 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX4O60224 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX4O60224 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSX4O60224 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSX4O60224 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSX4O60224 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX4O60224 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSX4O60224 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSX4O60224 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX4O60224 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX4O60224 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX4O60224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSX4O60224 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX4O60224 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX4O60224 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX4O60224 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX4O60224 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX4O60224 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX4O60224 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX4O60224 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX4O60224 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX4O60224 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX4O60224 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX4O60224 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX4O60224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX4O60224 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX4O60224 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX4O60224 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX4O60224 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX4O60224 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX4O60224 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX4O60224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX4O60224 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX4O60224 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX4O60224 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX4O60224 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX4O60224 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX4O60224 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX4O60224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX4O60224 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX4O60224 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX4O60224 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX4O60224 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX4O60224 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX4O60224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX4O60224 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX4O60224 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX4O60224 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX4O60224 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX4O60224 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX4O60224 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX4O60224 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX4O60224 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX4O60224 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX4O60224 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX4O60224 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 383 ms