Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN12O43309 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZSCAN12O43309 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZSCAN12O43309 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSCAN12O43309 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZSCAN12O43309 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZSCAN12O43309 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZSCAN12O43309 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSCAN12O43309 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSCAN12O43309 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN12O43309 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZSCAN12O43309 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZSCAN12O43309 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN12O43309 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms