Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DYNC1I1O14576 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DYNC1I1O14576 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DYNC1I1O14576 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DYNC1I1O14576 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DYNC1I1O14576 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DYNC1I1O14576 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DYNC1I1O14576 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DYNC1I1O14576 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DYNC1I1O14576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DYNC1I1O14576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DYNC1I1O14576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DYNC1I1O14576 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DYNC1I1O14576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DYNC1I1O14576 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DYNC1I1O14576 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DYNC1I1O14576 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DYNC1I1O14576 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms