Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPH6UMI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPH6UMI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPH6UMI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPH6UMI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPH6UMI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPH6UMI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPH6UMI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms