Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOTOA8MTQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOTOA8MTQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOTOA8MTQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOTOA8MTQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOTOA8MTQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOTOA8MTQ0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOTOA8MTQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOTOA8MTQ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOTOA8MTQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOTOA8MTQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms