Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPD8

KDM4F, Lysine demethylase 4F, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4FA0A1W2PPD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM4FA0A1W2PPD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM4FA0A1W2PPD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM4FA0A1W2PPD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM4FA0A1W2PPD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM4FA0A1W2PPD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
KDM4FA0A1W2PPD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
KDM4FA0A1W2PPD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
KDM4FA0A1W2PPD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM4FA0A1W2PPD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM4FA0A1W2PPD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM4FA0A1W2PPD8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM4FA0A1W2PPD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
KDM4FA0A1W2PPD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM4FA0A1W2PPD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM4FA0A1W2PPD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KDM4FA0A1W2PPD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KDM4FA0A1W2PPD8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM4FA0A1W2PPD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.88■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM4FA0A1W2PPD8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM4FA0A1W2PPD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM4FA0A1W2PPD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
KDM4FA0A1W2PPD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
KDM4FA0A1W2PPD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
KDM4FA0A1W2PPD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
KDM4FA0A1W2PPD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KDM4FA0A1W2PPD8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
KDM4FA0A1W2PPD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KDM4FA0A1W2PPD8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM4FA0A1W2PPD8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
KDM4FA0A1W2PPD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM4FA0A1W2PPD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KDM4FA0A1W2PPD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
KDM4FA0A1W2PPD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms