Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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