Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GNG12-AS1-203ENST00000420587 2232 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF621-203ENST00000403205 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL353801.2-201ENST00000436877 1444 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SCML4-202ENST00000369021 2056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TRAF3IP2-206ENST00000368735 903 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC005102.1-201ENST00000403118 479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LINC00539-202ENST00000423575 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC020917.1-201ENST00000494084 893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GNGT2-202ENST00000503070 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 OLR1-211ENST00000545927 1008 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MIR3183-201ENST00000578566 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 KCNA2-207ENST00000638532 2426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LAMP3-202ENST00000466939 1453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF619-209ENST00000521353 1869 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LRP1-207ENST00000554174 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MOCS1P1-201ENST00000564020 1612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC096637.2-202ENST00000421933 1846 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 IL1RAP-207ENST00000422485 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC027801.1-201ENST00000376609 2100 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LINC00954-201ENST00000433669 2472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CRX-202ENST00000539067 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SLC17A2-201ENST00000265425 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AP4S1-205ENST00000554345 1491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL356417.2-201ENST00000419064 395 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 BNIP3P20-201ENST00000604827 578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms