Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A4Q9Y6R1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A4Q9Y6R1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A4Q9Y6R1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms