Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COX11Q9Y6N1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms