Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF6Q9Y4K3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF6Q9Y4K3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms