Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTCL1Q9Y4B5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTCL1Q9Y4B5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTCL1Q9Y4B5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms